Sin duda, uno de los paisajes más llamativos y que más visitantes atraen al Parque Regional del Sureste (PRS) son las lagunas, no solo por su valor paisajístico sino también por toda la fauna y flora que tiene asociada. Los humedales son uno de los 5 ecosistemas que podemos encontrar en el PRS y dentro de él podemos encontrar 123 humedales catalogados y  protegidos por la Comunidad de Madrid, de origen artificial.

Aunque actualmente son consideradas como zonas con un alto valor ecológico, estas extensiones de agua no siempre han sido vistas con tanto cariño. Las zonas pantanosas han estado asociadas a zonas poco productivas, con poco valor y como focos de enfermedades. Por eso, desde muy antiguo se han desecado y destruido estas zonas para convertirlas en campos de cultivos y tierras más útiles y productivas para el ser humano.  Por este motivo, desde los años 60 se han perdido a nivel mundial alrededor del 60% de los humedales.

Entre la rica biodiversidad de la que hablábamos antes podemos destacar en cuanto a la flora, o más conocida como vegetación palustre: enea o espadaña (Thypa domingensis), carrizo (Phragmites australis) y juncos churreros (Scirpus holoschoenus) entre otros, y como especie invasora la caña (Arundo donax). Estas plantas necesitan grandes cantidades de agua para crecer por lo que se sitúan a las orillas de las 123 lagunas que podemos encontrar en el Parque y a las orillas de los ríos.

La vegetación palustre sirve como refugio a las diferentes especies de animales que podemos encontrar en este ecosistema. Entre otras aquí viven distintas especies de invertebrados, reptiles, anfibios, peces, aves y mamíferos. Las aves es el grupo de fauna con mayor diversidad de especies y entre ellas se encuentran desde las especies más comunes como fochas (Fulica atra), gallinetas (Gallinula chloropus), somormujos (Podiceps cristatus), ánades reales (Anas platyrhynchos), patos cucharas (Anas clypeata), zampullines (Tachybaptus ruficollis), etc. o los esquivos y menos numerosos como el calamón (Porphyrio porphyrio), el aguilucho lagunero (Circus aeruginosus), la garza imperial (Ardea purpurea) o el avetorillo (Ixobrychus minutus).